Además del objetivo básico de lograr una formación básica que permita continuar con los Estudios de Doctorado en Química Teórica y Modelización Computacional, el perfil del programa garantiza que los egresados sean buenos candidatos para optar a trabajos en la industria farmacéutica, compañías petroquímicas e industrias de nuevos materiales, poseyendo, a su vez, un perfil adecuado para trabajar con provecho en cualquier compañía como expertos en computación (finanzas y economía, computación, tecnologías de la información, data mining, asesoría en problemas de decisión y optimización, estadística, investigación y desarrollo etc).