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  • Un nuevu métodu computacional dexa analizar los cambeos xenéticos en pacientes de cáncer en poques hores

    26 de Ochobre 2014

    Nel trabayu, que güei publica la prestixosa revista Nature Biotechnology, participaron el profesores de la Universidá d'Uviéu Xose S. Ponte y Carlos López-Otín. SMUFIN ye capaz de detectar de forma senciella, rápida y precisa alteraciones xenétiques responsables de l'apaición y progresión de tumores

    Un nuevu métodu computacional fai posible la detección rápida, precisa y senciella de los cambeos genómicos responsables de l'apaición y progresión de tumores. Esti métodu, llamáu SMUFIN (por Somatic Mutations Finder), ye capaz d'analizar el xenoma completu d'un tumor y detectar les sos mutaciones en poques hores, y amás consigue alcontrar alteraciones qu'hasta'l momentu permanecíen ocultes inclusive con métodos que riquíen l'usu de supercomputadores mientres selmanes.

    La prestixosa revista Nature Biotechnology publica güei un artículu describiendo les característiques de SMUFIN, que foi desenvueltu pol grupu de xenómica computacional del Barcelona Supercomputing Center - Centru Nacional de Supercomputación (BSC-CNS) que lidera'l Dr y Profesor de ICREA David Torrents, en collaboración con grupos d'investigación del Hospital Clínic l'Institutu d'Investigación Biomédica August Pi i Sunyer (IDIBAPS) de Barcelona, l'Institutu d'Oncoloxía de la Universidá d'Uviéu (IUOPA), el European Molecular Biology Laboratory (EMBL, Heidelberg) y el Centru Nacional d'Analís Genómico (CNAG, Barcelona).

    Meyores nel estudiu de tumores agresivos

    L'artículu publicáu en Nature Biotechnology reflexa como SMUFIN, amás d'acelerar y abaratar l'analís, ye capaz d'afayar alteraciones xenétiques en tumores agresivos difíciles de detectar. L'analís por aciu SMUFIN de dos tipos de tumores agresivos, unu sanguíneu (linfoma de célules de mantu) y otru del sistema nerviosu (Meduloblastoma Pediátricu), dexó atopar, per primer vegada y con una precisión cimera al 90%, prácticamente tolos tipos de mutaciones asocedíes nos sos xenomes, incluyíes alteraciones na organización de los cromosomes que permanecieron ocultes a los métodos usaos hasta la fecha. Esto supon el primer pasu necesariu pa poder entender cómo afecten estes alteraciones cromosómicas a la evolución y a l'agresividá del tumor.

    Impulso a la medicina personalizada

    SMUFIN supon un pasu firme y realista nel horizonte de la medicina personalizada, na que l'analís del xenoma de cada paciente va facilitar el so diagnósticu de forma más rápida y precisa, y va dexar el desenvolvimientu y l'aplicación de tratamientos personalizaos más eficaces y menos agresivos que los actuales. Ente que los métodos esistentes hasta'l momentu resulten complexos, llindaos y riquen díes o selmanes pal analís completu d'un xenoma de tumor,  SMUFIN supon una opción realista nel procesu de la incorporación del analís genómico al sistema sanitariu, yá que ye capaz d'analizar, en poques hores, un xenoma de tumor de forma precisa y técnicamente senciella.

    SMUFIN empezó a desenvolvese nel Barcelona Supercomputing Center – Centru Nacional de Supercomputación, nel 2011. El desenvolvimientu producióse en dos redolaes d'investigación nos que participa  el centru. Unu ye'l Proyectu Xenoma de la Leucemia Linfática Crónica, del que son directores científicos Elías Campu (Hospital Clínic, IDIBAPS) y Carlos López-Otín (Universidá d'Uviéu) y que tien como oxetivu l'estudiu de la leucemia al traviés del analís genómico de más de 500 pacientes. Esti desenvolvimientu tamién forma parte del Programa Nacional Severu Ochoa, col que'l Barcelona Supercomputing Center impulsa, ente otres, la creación de ferramientes bioinformáticas capaces de xestionar y analizar grandes cantidaes de datos biomédicos necesarios pa faer posible la medicina personalizada.


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